Proces kalkulacji ulgi IP Box można podzielić na 3 etapy:

1. Obliczenie dochodu z praw własności intelektualnej

W tym celu należy obliczyć wysokość dochodu, który osiągnięto z każdego z posiadanych kwalifikowanych praw IP.

Dochody mogą pochodzić z: 

• opłat lub należności z umowy licencyjnej, która dotyczy kwalifikowanego prawa własności (np. licencja na wytworzony przez przedsiębiorstwo program komputerowy);
• ze sprzedaży kwalifikowanego prawa własności intelektualnej (np. ze zbycia patentu);
• prawa uwzględnionego w cenie sprzedaży produktu lub usługi (np. dochód z patentu uwzględnionego w cenie);
• odszkodowań za naruszenie praw wynikających z kwalifikowanego prawa własności intelektualnej.

2. Obliczenie kwalifikowanego dochodu z praw własności intelektualnej

Na tym etapie należy skalkulować poziom wskaźnika NEXUS, a następnie pomnożyć przez niego dochody z kwalifikowanych IP.

Wskaźnik NEXUS jest mnożnikiem korekcyjnym, każdorazowo wyliczanym w oparciu o poniesione koszty związane z kwalifikowanym prawem IP.

3. Ustalenie poziomu ulgi IP Box

Do wyliczenia podstawy opodatkowania należy zsumować wszystkie kwalifikowane dochody z kwalifikowanych praw. Następnie należy przemnożyć tą wartość przez preferencyjną stawkę podatku dochodowego IP Box wynoszącą 5%.